1.主体不同

税务稽查:税务稽查的主体是税务专业稽查机构税收检查:税务检查主体可以是各类税务机关不过征收、管理机构所从事的税收检查活动实际上是其管理活动的组成部分，是管理的一种手段。

2.对象不同

税务稽查的对象是依据举报或科学选案而确定的有涉嫌违法行为的纳税人、扣缴义务人。

税收检查的对象可以是所有的纳税人和扣缴义务人，只要税务机关认为有必要即可对其纳税和扣缴情况进行核查。

3.程序不同

税务稽查必须根据国家税务总局制定的《税务稽查工作规程》，经过选案、实施、审理、执行4个环节。

税收检查的程序相对简单4.目的不同

税务稽查一般是为打击偷逃税违法犯罪行为，对涉嫌违法的纳税人进行全面、彻底的检查，以震慑犯罪，维护税收秩序。税收检查往往是由于某种管理上的需要对纳税人的某一税种、纳税事项或诺鸿某一时点的情况进行检查和审核。